「スプリンターセル 二重スパイ」ではプレイヤーはサム・フィッシャー（アメリカの国家安全保障局のエージェント）として、テロリストの一員に扮し内部から組織の崩壊を試みる。二重スパイとして課せられる過酷な任務と選択を経て、作戦を無事完了して脱出することができるのか。 オンライン・マルチプレイヤーでプレイヤーはスパイまたはスパイを阻止する傭兵となり、潜入とハッキング、侵入者の発見と排除、という対立した立場でプレイできる。傭兵側のハイテク装備と自動防御システムに対してアクロバットのような動きでマップの隅々まで移動可能なスパイ。この両者の長所を生かし、各々の任務を成功させなければならない。このように3対3で仲間と協力しながら対戦するモードとは別に、敵AIを相手にプレイヤー同士協力してプレイするモードも用意されている。